ユーザーミュートの設定画面から “公式RTをミュート” を選ぶと特定のユーザーのRTのみミュートすることが出来ます。

ユーザーミュートを設定していない場合、ツイートのスワイプで表示されるユーザーミュートボタンから
“詳細を編集” → “公式RTをミュート”で追加できます。